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질량분석법을 이용한 신속하고 정확한 미생물 식별 방법을 메틸로박테리움 박테리아에 적용
[저자]타니 A, 사힌 N, 마쓰야마 Y, 에노모토 T, 니시무라 N, 요코타 A, 킴바라 K
[논문 제목] 소설의 높은 처리량 식별 및 심사메틸로박테리움전세포 MALDI-TOF/MS 분석을 사용하는 종
[출판논문] PLoS ONE 7(7): e40784 doi:101371/journalpone0040784
[공동 파치 슬롯] 터키 무그라 대학, Bruker Daltonics Co, Ltd, 오카야마 과학 대학, 인도네시아 대학
[공통사용장비] DNA 서열분석기, MALDI-TOF/MS
[콘텐츠 소개]
박테리아를 속, 종 및 계통 수준에서 분류하기 위한 많은 방법이 개발되었습니다 예를 들어 속(genus) 수준에서는 콜로니의 형태에 따라 어느 정도 구별이 가능하지만 종(species) 수준에서는 구별이 거의 불가능하고, 더욱이 균주(strain) 수준에서는 DNA 염기서열 수준과 비교하지 않으면 현재로서는 구별이 불가능하다 이러한 현 상황을 극복하기 위한 새로운 방법으로 최근에는 질량분석기를 이용하여 박테리아를 구성하는 다양한 단백질의 분자량을 한꺼번에 측정하고, 분자량 패턴을 비교함으로써 종 수준뿐만 아니라 균주 수준까지 즉각적으로 파악하는 기술이 개발되었다 본 파치 슬롯에서는 식물 표면에 풍부하고 식물이 방출하는 메탄올을 영양원으로 사용하여 자라는 메틸로박테리움(Methylobacterium) 박테리아에 이 방법을 적용했습니다 그 결과, 알려지지 않은 많은 박테리아가 발견되었으며, 그 중 일부는 이미 새로운 박테리아로 발표되었습니다 본 보고서에서는 새로운 박테리아의 발견에 대해 논의할 뿐만 아니라 이 방법의 최적화, 검출된 분자량 피크의 기원, 이 방법을 사용하여 분류할 수 없는 이 속의 박테리아 종, 그리고 이들이 분리된 식물 종과 곰팡이 종 간의 상관 관계에 대해서도 논의합니다 이 방법을 이용하면 겉모습만으로는 구별할 수 없는 세균을 쉽게 구별할 수 있고, 다수의 분리균주 중에서 동일한 세균은 제거하고, 유전적으로 다른 세균만 수집할 수 있다
(식물-미생물 상호작용 그룹, 타니 아키오 작성)
관련 링크:식물-미생물 상호작용 그룹
